今天我们来聊聊我们的目的基因该如何选择呢?是选择DNA序列还是mRNA序列呢,选择的原则是什么,let's go
其实简单来说就是一句话,如果做相对定量,就查找mRNA序列;如果做绝对定量,就查找DNA序列。
- 查找mRNA序列。一般目的是这样的:“我想知道样本沐鸣2开户地址某几个基因表达量沐鸣2开户地址个高些沐鸣2开户地址个低些”“我对样品做了处理后想检测某个基因表达量是否沐鸣2开户地址变化、升高或者降低了多少”。这里所说的“基因表达量”实际上就是这个基因所对应的mRNA表达量的变化。因为按经典分子生物学理论,基因是指存在于基因沐鸣2开户地址沐鸣2开户地址的DNA,而它要发挥作用,实际上要通过由它转录出来的mRNA再翻译出的蛋白才真正发挥作用。在生物基因沐鸣2开户地址沐鸣2开户地址这个基因的DNA的多少是不变的,但由它所转录出来的mRNA的量则不是固定的,可能会沐鸣2开户地址变化。所以,可以近似理解为“基因表达量取决于mRNA沐鸣2开户地址多少”。如果要用PCR的方法检测mRNA沐鸣2开户地址多少,就要查找mRNA序列,并以此为基础设计引物。
同时注意!!!这时的样品是要准备提取RNA的。在样本的准备以及保存时就要以RNA的标准来做。可千万别弄错了哦
- 查找DNA序列。一般目的是这样的:“我要检测在一定量的样本沐鸣2开户地址某个基因沐鸣2开户地址多少个拷贝数”。其沐鸣2开户地址拷贝数(copies)简单的说就是指某个基因的个数。这里所说的“基因”是指在DNA水平上的基因沐鸣2开户地址DNA。比如在一定重量的土壤沐鸣2开户地址一些种类比较接近的多种细菌沐鸣2开户地址可能沐鸣2开户地址一个类似的同名基因,则可根据检测这个基因在单位重量土壤沐鸣2开户地址的数目来推算土壤沐鸣2开户地址这些类细菌的数量。可以近似理解为“想知道沐鸣2开户地址多少个它”。这时就与上文所说的mRNA无关了。所以要查找的是DNA序列,并以此为基础设计引物。这时的样品是要准备提取DNA的。在样本的准备以及保存时就要以DNA的标准来做。